福建商学院马尾校区有国际经济与贸易、国际商务、国际金融、证券与期货、金融保险、工商企业管理、市场营销、电子商务、物联网应用技术、计算机信息管理、软件技术、动漫设计与制作、动漫设计与制作等专业。

截至2020年6月，福建商学院有鼓楼、连江、马尾三个校区，占地面积1500余亩；下设14个二级教学单位，设有26个本科专业和30余个专科专业；有专任教师604人，其中高级职称263人，博士、硕士学位498人。

截至2020年6月，学校设有国际经贸学院、金融学院、工商管理学院、财务与会计学院、信息工程学院、旅游与休闲管理学院、外国语学院、艺术设计学院、传媒与会展学院、体育教学部、马克思主义学院、海外教育学院、继续教育学院、创新创业教育中心（通识教育学院）等共计14个二级教学单位。